En un futur llunyà, des que la Terra s'ha superpoblat, han començat els esforços per trobar i colonitzar altres planetes. No obstant això, una de les naus, la "Mesopotàmia" funciona malament i tots els seus tripulants, menys 6, moren. Els 6 restants aconsegueixen escapar a un planeta proper anomenat "Terra ll", que és similar a la Terra en molts aspectes. No obstant això, tots són homes. Per això, per no perdre els seus esforços, comencen a establir 6 països i a reproduir-se mitjançant la clonació i l'enginyeria genètica. Tanmateix, encara no hi ha dones, i per compensar-ho creen androides femenines avançades realistes anomenades "Marionetes" que fan les tasques i treballs quotidians. Tanmateix, totes són màquines sense emocions. Però un dia, un noi normal anomenat Otaru troba i desperta 3 Marionetes de tipus de batalla especials que tenen emocions a causa d'un "Circuit de Donzella" dins d'elles. Depèn d'ell llavors ensenyar-lis i permetre que les seves emocions creixin, i quan un país proper amenaça de dominar el món, correspon a l'Otaru i a les seves Marionetes "humanes" protegir el seu país.

El joc en línia The World té captivats milers de jugadors de tot el món; però passa quelcom imprevist: en Tsukasa, un jove jugador, queda atrapat dins del joc. Un grup de jugadors intrigats per ell i els misteris de The World intentaran apropar-s'hi per ajudar-lo. De mica en mica es descobreix que The World amaga misteris inexplicables i que l'estrany comportament d'en Tsukasa podria estar vinculat amb un misteriós element del lore de The World: la llegendària Clau del Crepuscle.

La Saya Otonashi és una noia aparentment normal que viu una vida mundana amb la seva família adoptiva a la ciutat d’Okinawa. De fet, les seves úniques particularitats són patir anèmia i ser incapaç de recordar res de la seva vida més enllà de l'any anterior. No obstant això, el passat oblidat de la Saya torna ràpidament a perseguir-la: una nit, és atacada a l'institut per una criatura que s'alimenta de sang humana. Just quan tota esperança sembla perduda, apareix un misteriós home anomenat Haji que fa fora la criatura temporalment. Però quan el seu rescatador l’obliga a beure’s la seva sang, la Saya entra de sobte en un estat de trànsit i assassina el monstre amb facilitat, fent servir la seva pròpia sang com a catalitzador. Aleshores, la Saya descobreix una organització anomenada Red Shield, fundada amb l’únic propòsit de derrotar les bèsties infernals. Ara la Saya i en Haji han de treballar juntament amb Red Shield per lluitar contra aquests temibles monstres i desbloquejar els secrets del passat de la noia.

Any 1926. La Su-a és una noia de 17 anys que treballa com a serventa a casa d'un terratinent de Joseon (l'actual Corea), que en aquells moments es troba sota el domini colonial de l'Imperi Japonès. Un dia, en una escapada a la platja, la Su-a hi troba un noi inconscient i decideix tenir-ne cura fins que es recuperi. Però aquest noi és membre del Moviment d'Independència de Joseon, un bàndol totalment oposat al del seu amo, que és un dels principals aliats dels japonesos a la regió de Gunsan...